Федеральная космическая программа России на 2006 - 2015 годы
Федеральная целевая программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007 - 2013 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие гражданской авиационной техники России на 2002 - 2010 годы и на период до 2015 года"
Федеральная целевая программа "Развитие телерадиовещания в Российской Федерации на 2009 - 2018 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие российских космодромов на 2006 - 2015 годы"
   Подпрограмма "Создание обеспечивающей инфраструктуры космодрома "Восточный"
   Федеральная целевая программа "Развитие российских космодромов на 2006 - 2015 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие гражданской морской техники" на 2009 - 2016 годы
Федеральная целевая программа "Развитие электронной компонентной базы и радиоэлектроники" на 2008 - 2015 годы
Федеральная целевая программа "Национальная технологическая база" на 2007 - 2011 годы
   Подпрограмма "Создание и организация производства в Российской Федерации в 2011 - 2015 годах дизельных двигателей и их компонентов нового поколения"
   Подпрограмма "Развитие отечественного станкостроения и инструментальной промышленности" на 2011 - 2016 годы
Федеральная целевая программа "Ядерные энерготехнологии нового поколения на период 2010 - 2015 годов и на перспективу до 2020 года"
Федеральная целевая программа "Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую перспективу"
Федеральная целевая программа "Поддержание, развитие и использование системы ГЛОНАСС на 2012 - 2020 годы"
Федеральная целевая программа "Совершенствование системы комплектования должностей сержантов и солдат военнослужащими, переведенными на военную службу по контракту, и осуществление перехода к комплектованию должностей сержантов (старшин) Вооруженных Сил Российской Федерации, других войск, воинских формирований и органов, а также матросов плавсостава Военно-Морского Флота военнослужащими, проходящими военную службу по контракту (2009 - 2015 годы)"
Федеральная целевая программа "Жилище" на 2011 - 2015 годы
   Подпрограмма "Обеспечение жильем молодых семей"
   Подпрограмма "Модернизация объектов коммунальной инфраструктуры"
   Подпрограмма "Стимулирование программ развития жилищного строительства субъектов Российской Федерации" федеральной целевой программы "Жилище" на 2011-2015 годы
   Подпрограмма "Выполнение государственных обязательств по обеспечению жильем категорий граждан, установленных федеральным законодательством"
   Мероприятия по обеспечению жильем отдельных категорий граждан
   Расходы на управление Программой
Федеральная целевая программа "Развитие транспортной системы России (2010 - 2021 годы)"
   Подпрограмма "Развитие экспорта транспортных услуг"
   Подпрограмма "Железнодорожный транспорт"
   Подпрограмма "Автомобильные дороги"
   Подпрограмма "Морской транспорт"
   Подпрограмма "Внутренний водный транспорт"
   Подпрограмма "Гражданская авиация"
   Расходы общепрограммного характера по федеральной целевой программе "Развитие транспортной системы России (2010 - 2021 годы)"
   Подпрограмма "Государственный контроль и надзор в сфере транспорта"
Федеральная целевая программа "Экономическое и социальное развитие Дальнего Востока и Байкальского региона на период до 2018 года"
   Подпрограмма "Развитие города Владивостока как центра международного сотрудничества в Азиатско-Тихоокеанском регионе"
   Федеральная целевая программа "Экономическое и социальное развитие Дальнего Востока и Забайкалья на период до 2013 года", за исключением подпрограммы "Развитие г.Владивостока как центра международного сотрудничества в Азиатско-Тихоокеанском регионе"
Федеральная целевая программа "Социальное развитие села до 2013 года"
Федеральная целевая программа "Сохранение и восстановление плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения и агроландшафтов как национального достояния России на 2006 - 2010 годы и на период до 2013 года"
Федеральная целевая программа "Повышение эффективности использования и развитие ресурсного потенциала рыбохозяйственного комплекса в 2009 - 2012 годах"
Федеральная целевая программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы
Федеральная целевая программа "Развитие физической культуры и спорта в Российской Федерации на 2006 - 2015 годы"
   Подпрограмма "Развитие футбола в Российской Федерации на 2008 - 2015 годы"
   Расходы общепрограммного характера по федеральной целевой программе "Развитие физической культуры и спорта в Российской Федерации на 2006 - 2015 годы"
Федеральная целевая программа "Предупреждение и борьба с социально значимыми заболеваниями (2007 - 2012 годы)"
   Подпрограмма "Сахарный диабет"
   Подпрограмма "Туберкулез"
   Подпрограмма "Вакцинопрофилактика"
   Подпрограмма "ВИЧ-инфекция"
   Подпрограмма "Онкология"
   Подпрограмма "Инфекции, передаваемые половым путем"
   Подпрограмма "Вирусные гепатиты"
   Подпрограмма "Психические расстройства"
   Подпрограмма "Артериальная гипертония"
Федеральная целевая программа развития образования на 2011 - 2015 годы
Федеральная целевая программа ""Русский язык" на 2011 - 2015 годы
Федеральная целевая программа "Охрана озера Байкал и социально-экономическое развитие Байкальской природной территории на 2012 - 2020 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие внутреннего и въездного туризма в Российской Федерации (2011 - 2018 годы)"
Государственная программа "Доступная среда" на 2011 - 2015 годы
Федеральная целевая программа "Чистая вода" на 2011 - 2017 годы
Федеральная целевая программа "Культура России (2012 - 2018 годы)"
Федеральная целевая программа "Развитие водохозяйственного комплекса Российской Федерации в 2012 - 2020 годах"
Федеральная целевая программа "Уничтожение запасов химического оружия в Российской Федерации"
Федеральная целевая программа "Обеспечение ядерной и радиационной безопасности на 2008 и на период до 2015 года"
Федеральная целевая программа "Повышение устойчивости жилых домов, основных объектов и систем жизнеобеспечения в сейсмических районах Российской Федерации на 2009 - 2018 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие уголовно-исполнительной системы (2007 - 2016 годы)"
Федеральная целевая программа "Модернизация Единой системы организации воздушного движения Российской Федерации (2009 - 2020 годы)"
Федеральная целевая программа "Пожарная безопасность в Российской Федерации на период до 2012 года"
Федеральная целевая программа "Национальная система химической и биологической безопасности Российской Федерации (2009 - 2014 годы)"
Федеральная целевая программа "Повышение безопасности дорожного движения в 2006 - 2012 годах"
Федеральная целевая программа "Создание системы базирования Черноморского флота на территории Российской Федерации в 2005 - 2021 годах"
Федеральная целевая программа "Мировой океан" (проект)
   Подпрограмма "Военно-стратегические интересы России в Мировом океане"
   Подпрограмма "Исследование природы Мирового океана"
   Подпрограмма "Освоение и использование Арктики"
   Подпрограмма "Изучение и исследование Антарктики"
   Подпрограмма "Создание единой государственной системы информации об обстановке в Мировом океане"
   Мероприятия Государственного заказчика-координатора
Федеральная целевая программа "Совершенствование федеральной системы разведки и контроля воздушного пространства Российской Федерации (2007 - 2015 годы)"
Федеральная целевая программа "Снижение рисков и смягчение последствий чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера в Российской Федерации до 2015 года"
Федеральная целевая программа "Обеспечение безопасности полетов воздушных судов государственной авиации Российской Федерации в 2011 - 2015 годах"
Федеральная целевая программа "Промышленная утилизация вооружения и военной техники на 2011 - 2015 годы и на период до 2020 года"
Федеральная целевая программа "Преодоление последствий радиационных аварий на период до 2015 года"
Федеральная целевая программа "Государственная граница Российской Федерации (2012 - 2020 годы)"
Федеральная целевая программа "Социально-экономическое развитие Чеченской Республики на 2008 - 2012 годы"
Федеральная целевая программа "Юг России (2008 - 2013 годы)"
Федеральная целевая программа развития Калининградской области на период до 2020 года
Федеральная целевая программа "Социально-экономическое развитие Республики Ингушетия на 2010 - 2016 годы"
Федеральная целевая программа "Социально-экономическое развитие Курильских островов (Сахалинская область) на 2007 - 2015 годы"
Федеральная целевая программа "Социально-экономическое и этнокультурное развитие российских немцев на 2008 - 2012 годы"
Федеральная целевая программа "Развитие судебной системы России" на 2007 - 2012 годы
Подпрограмма "Создание системы кадастра недвижимости (2006 - 2012 годы)" федеральной целевой программы "Создание автоматизированной системы ведения государственного земельного кадастра и государственного учета объектов недвижимости (2002 - 2008 годы)"
Государственная программа "Информационное общество (2011 - 2020 годы)"